Es la síntesis de la información existente y de los datos estructurados que identifican las relaciones funcionales entre los procesos naturales y los varios componentes del ecosistema (sensu McKensie & Barclay).
Varios de los objetivos de la caracterización ecológica son, a saber:
- Ensamblar, revisar y sintetizar la información biofísica y socioeconómica existente y establecer una base de información sonora para el proceso de toma de decisiones.
- Identificar y describir varios componentes del paisaje, como subsistemas, hábitats, comunidades y especies clave.
- Describir los principales nexos y las interacciones entre los diferentes componentes del sistema.
- Describir las potenciales y reales respuestas del ecosistema frente a los disturbios que impactan el medio ambiente.
- Identificar las deficiencias de información y establecer las prioridades de investigación.